关于手持式光谱仪中X射线的辐射问题，一直都是企业、国家关注的问题。而如今光谱分析仪器应用行业却相当广泛，如电子、电器、珠宝、玩具、食品、建材、冶金、地矿、塑料、医药、钢铁冶金、机械制造、航空航天、食品卫生、环境保护以及教学科研等各个领域。而长期的使用就得对辐射安全问题深入了解了。
首先设备本身应带有射线的屏蔽装置。比如说防护铅板和铅玻璃，其次，管头有光闸或者防护罩，主要照射面应该是密不透风的。至于漏散的部分，计量相对于要照射面更小，且波长变长。对人体的危害可以认为更小了。x射线是直线不会拐弯。
能量色散型X射线荧光光谱仪（ED-XRF）大致可划分至III类5级射线装置，在射线装置行业内属于极低辐射等级装置。这里需要提醒的是，手持式的ED-XRF不能这样认为，手持式EDXRF的X射线在工作状态是开场式（大约成25度角），如果利用手持式EDXRF对样品进行检测，应该需要注意禁止照射人体或面向人体方向照射。
EDXRF设备应通过当地的环境保护局的辐射安全监测，颁发辐射安全合格证书。
一个人一年吸收辐射在2000usv以内是正常的，对身体不会有影响
一般可以在3000usv，也不会有太大影响，专业人士（经常使用X荧光仪器的人 ）可以加到20000usv是允许的，有的时候专业人士可以加到50000usv。<
法律允许人一年所吸收辐射值为50000usv。
仪器由于包装材料好，不会放出X射线，只有枪口有X射线。
当然，规范适当的使用光谱分析仪是可以避免很多不必要的伤害。
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